关于“以班数少为由扣除工资缴纳公司部分社保是否违法”的问题，结合法律依据分析如下：
《中华人民共和国社会保险法》（2018修正）第六十条明确：“用人单位应自行申报、按时足额缴纳社保费，非因不可抗力不得缓缴、减免。职工应缴部分由用人单位代扣代缴，用人单位需按月告知缴费明细。”
由此可见，用人单位有自行缴纳社保的法定义务，职工仅承担个人部分且由单位代扣代缴。公司以“班数少”为由扣除工资缴纳公司应承担的社保，属于将法定义务转嫁职工，明显违法。
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处理“以班数少为由扣除工资缴纳公司部分社保”问题时，需注意以下特殊情形：
1、书面约定的效力：若职工与公司在劳动合同中明确约定“班数少”时职工自愿承担公司社保费用，且约定不违反法律强制性规定，可能影响处理结果。但需明确：社保缴纳是法定强制性义务，约定不能免除公司法定义务，仅可能形成双方内部权利义务关系。
2、不可抗力情形：根据《中华人民共和国社会保险法》，用人单位非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免社保费。若公司因不可抗力（如自然灾害、战争）无法按时足额缴纳社保，可申请缓缴等特殊处理，但这与“班数少”扣除工资属于不同情形，不能以此为由违法扣薪。
3、特殊用工形式：非全日制从业人员社保由个人直接缴纳，但全日制劳动关系职工不能以“特殊用工形式”为由，免除公司缴纳社保的义务。
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面对“以班数少为由扣除工资缴纳公司部分社保”的情况，需避免以下错误操作：
1、忽视证据收集：部分职工未及时保留工资条、社保记录等证据，导致维权时难以证明公司违法，增加维权难度。
2、激化矛盾冲突：沟通时情绪激动、发生激烈冲突，不仅不利于问题解决，还可能影响自身处境，甚至给公司留下不良印象。
3、拖延维权时效：劳动争议仲裁时效为一年，超过时效可能丧失仲裁维权机会。
若不慎出现上述错误，建议尽快补救，必要时可咨询我获取专业解答。
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您询问的“以班数少为由扣除工资缴纳公司部分社保是否违法”，答案是违法的。
法律规定社保费用由用人单位和职工共同缴纳，公司不得将自身应承担部分转嫁职工工资中扣除。
若公司已明确告知职工、双方协商一致且不违反法律强制性规定的特殊情况，需具体分析，但一般情况下公司不能单方面以此为由扣薪。

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